Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIVEP3Q5T1R4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIVEP3Q5T1R4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms