Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NHSL1Q5SYE7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms