Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms