Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA8Q53HL2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms