Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSD17B12Q53GQ0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSD17B12Q53GQ0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms