Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTXN3Q4LDR2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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