Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRNQ4KMQ1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms