Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TWISTNBQ3B726 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms