Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFX4Q33E94 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RFX4Q33E94 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFX4Q33E94 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFX4Q33E94 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFX4Q33E94 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFX4Q33E94 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFX4Q33E94 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFX4Q33E94 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms