Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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