Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDO1Q16878 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDO1Q16878 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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