Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPROQ16827 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms