Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B3Q16720 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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