Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPC1Q16533 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms