Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PRR4Q16378 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms