Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTRK3Q16288 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
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