Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC85BQ15834 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC85BQ15834 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms