Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SF3B3Q15393 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3B3Q15393 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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