Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF1Q15361 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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