Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms