Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD1Q15116 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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