Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLD3Q15054 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD3Q15054 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms