Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCAPHQ15003 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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