Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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COL19A1Q14993 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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COL19A1Q14993 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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COL19A1Q14993 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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COL19A1Q14993 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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COL19A1Q14993 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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COL19A1Q14993 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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COL19A1Q14993 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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COL19A1Q14993 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
COL19A1Q14993 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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