Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MDC1Q14676 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms