Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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