Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL9A3Q14050 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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