Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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COL4A6Q14031 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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COL4A6Q14031 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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COL4A6Q14031 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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COL4A6Q14031 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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COL4A6Q14031 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
COL4A6Q14031 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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