Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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