Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FHL3Q13643 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FHL3Q13643 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FHL3Q13643 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms