Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CUL4AQ13619 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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