Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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