Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CUL1Q13616 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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