Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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