Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
EIF4EBP1Q13541 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms