Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPP1R1AQ13522 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPP1R1AQ13522 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms