Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPM6BQ13491 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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