Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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