Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IKZF1Q13422 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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