Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB3BPQ13352 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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ITGB3BPQ13352 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB3BPQ13352 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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