Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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