Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GRIN2BQ13224 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
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