Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TP53BP1Q12888 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TP53BP1Q12888 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms