Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LOXL1Q08397 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms