Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR1Q08345 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms