Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms