Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEUP1Q05D60 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms