Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBE1Q04446 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms