Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARID5AQ03989 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARID5AQ03989 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARID5AQ03989 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms