Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLOD1Q02809 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLOD1Q02809 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms